Dicer
Dicer
Proteina citoplasmatica che appartiene alla famiglia delle ribonucleasi di tipo III, cioè ribonucleasi che digeriscono molecole di RNA a doppio filamento (dsRNA). Gli enzimi Dicer sono caratteristici degli organismi eucariotici e funzionano nel processo di interferenza genica guidato da molecole di dsRNA, o RNA interference (RNAi). Dicer usa come substrati o lunghe molecole di ;dsRNA, producendo i piccoli RNA interferenti (siRNA), o i precursori dei micro RNAs (RNA microscopici che inibiscono la traduzione di RNA messaggeri specifici). Gli enzimi Dicer degli Eucarioti superiori possiedono parecchi domini strutturali fra i quali sono di particolare rilevanza due domini ;RNasiIII presenti al terminale carbossilico: un domino PAZ, che è caratteristico delle proteine che funzionano nel processo di RNAi, e un dominio di tipo RNA elicasi, che si trova al terminale amminico della proteina. È importante notare, tuttavia, che la struttura degli enzimi Dicer è alquanto variabile. A differenza della ribonucleasi III batterica, che è un dimero di due sottounità identiche, Dicer funziona come monomero, e i due domini RNasi III della molecola dimerizzano per formare il sito attivo dell’enzima. A seconda dell’organismo, Dicer produce frammenti a doppio filamento di lunghezza variabile fra i 19 e i 26 nucleotidi. Molto probabilmente la variabilità della lunghezza dei siRNA è dovuta a differenze strutturali fra gli enzimi Dicer dei vari organismi. Si pensa che Dicer funzioni come un ruler molecolare e che misuri la distanza fra il sito di legame di una delle due estremità del dsRNA e il sito attivo dell’enzima. Alle estremità 3′-OH dei prodotti di digestione di Dicer risiedono due nucleotidi non appaiati, una caratteristica comune a tutti i prodotti di digestione delle RNAsi III.