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ITS (Internal transcribed spacer)

di Claudia Bertonati - Enciclopedia della Scienza e della Tecnica (2008)
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ITS (Internal transcribed spacer)

Claudia Bertonati

Regione non codificante del DNA ribosomiale che viene trascritta come parte del 35S rRNA. In particolare in Saccharomyces cerevisiae il DNA ribosomiale (rDNA) è codificato da una regione lunga approssimativamente 1÷2 Mb, costituita da 100÷200 ripetizioni in tandem di 9,1 kb. Ogni ripetizione contiene i geni per 5S, 5,8S, 25S, e 18S RNA ribosomiale ­(rRNA), così come tre tipi di regioni di spaziatura (spacer regions): spaziatori interni trascritti ITS1, ITS2, spaziatori esterni trascritti, 5′ETS, 3′ETS (external transcribed spacers) e spaziatori non trascritti NTS1, NTS2 (nontranscribed spacers). Come in molti eucarioti, i geni, codificanti per 18S, 5,8S, and 25S rRNA, sono trascritti dalla RNA polimerasi I in un singolo precursore il 35 pre-rRNA che include anche le due sequenze ITS1 e ITS2. La transcrizione inizia in 5′ETS e termina in 3′ETS. Il 5S rRNA è trascritto separatamente dalla RNA polimerasi III. Il 35S pre-rRNA è processato a partire dal taglio 3′ETS. Le regioni ITS si sono dimostrate essere un’ottima fonte di dati per studi filogenetici. L’allineamento e la comparazione delle sequenze di ITS è molto usato in tassonomia perchè sono facili da amplificare (grazie all’elevato numero di copie di rRNA) e hanno un alto tasso di mutazione anche tra specie vicine nella scala evolutiva. Probabilmente quest’osservazione si può spiegare con la bassa pressione evolutiva a cui sono sottoposte sequenze non funzionali.

→ Biosfera. Ecologia del plancton microbico

Vedi anche
contròllo gènico gènico, contròllo Processo di regolazione che permette a una cellula di esprimere solo alcuni dei suoi geni. In un determinato organismo, tutte le cellule possiedono lo stesso patrimonio genetico, ma una cellula muscolare, per es., è diversa da una cellula del sangue: la loro diversa funzione deriva ... tassonomia Nelle scienze naturali, termine usato spesso come sinonimo di sistematica (➔), ma che in modo più preciso viene utilizzato per indicare da un lato le regole nomenclaturali, dall’altro le tecniche per lo studio teorico della classificazione filogenetica dei viventi, attraverso la definizione esatta di ... filogenesi Storia evolutiva di un gruppo di organismi alla luce delle loro relazioni reciproche di discendenza e di affinità. Per lo studio della filogenesi in biologia evoluzionistica ci si avvale di dati morfologici, paleontologici ecc. Notevole è stato il contributo della biochimica allo studio delle diverse ... darwinismo Denominazione delle teorie elaborate da C. Darwin per interpretare l'evoluzione degli organismi attraverso il meccanismo della selezione naturale. Secondo il darwinismo, il campo di variabilità nel quale agisce il meccanismo di selezione può essere determinato sia da cause interne, di natura genetica, ...
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