motivo elica-ansa-elica
motivo elica-ansa-elica
Sequenza polipeptidica che si trova in alcuni fattori di trascrizione ed è capace di riconoscere sequenze specifiche di DNA. È stato inizialmente identificato in alcune proteine regolatrici dello sviluppo. È correlato al motivo a cerniera di leucine e non deve essere confuso con il motivo elica-curva-elica. La maggior parte delle proteine che posseggono il motivo elica-ansa-elica contengono un dominio basico (b) adiacente al motivo HLH (Helix loop helix). Pertanto, le proteine di tale gruppo sono chiamate proteine bHLH. Nel dettaglio, le proteine bHLH posseggono un dominio di 60 aminoacidi che contiene due distinte regioni funzionali: la regione basica e la regione HLH. La regione basica è localizzata all’N-terminale del dominio, è coinvolta nel legame con il DNA ed è costituita da amminoacidi prevalentemente basici. La regione HLH è localizzata al C-terminale del dominio, funziona come dominio di dimerizzazione ed è costituita prevalentemente da residui idrofobici che formano due α-eliche separate da un’ansa di lunghezza variabile. Le due α-eliche non sono uguali tra loro, ma abitualmente una è più breve mentre l’altra è più lunga. La flessibilità dell’ansa permette a un’elica di ripiegarsi e di compattarsi contro l’altra. Questa struttura proteica, ovvero la presenza della regione basica e della regione HLH, consente al dominio di legare sia il DNA sia il motivo elica-ansa-elica di un’altra proteina bHLH. Come nel caso delle proteine con cerniera di leucine, la seconda proteina bHLH può essere la stessa (creando un omodimero) o una diversa (creando un eterodimero). Diverse proteine HLH mancano dell’estensione ad α-elica responsabile dell’attacco al DNA.